Маска слоя представляет собой 8-битный полутоновой канал с черным или белым фоном. По умолчанию белые области маски слоя позволяют видеть пикселы, черные - скрывают точки, а серые - частично их маскируют. С помощью маски можно временно скрыть пикселы слоя так, чтобы была видна остальная часть изображения без них. Позднее можно изменить маску, применить эффект маски, чтобы она стала постоянной, или вообще удалить ее.
Преимущество использования маски заключается в том, что получить доступ к ней можно как с палитры Layers (Слои), так и с палитры Channels (Каналы). На обеих палитрах показывается миниатюра маски слоя, когда выделен содержащий ее слой. В отличие от альфа-канала выделенной области, который допускается загрузить в любой слой, маску слоя можно включить/выключить только для слоя или группы отсечения, с которым(ой) она связана.